La amenaza en la sombra se revela, atacando la Mansión Wayne y dejando indefenso a Alfred tras inyectarle una sobredosis de la Toxina del Miedo del Espantapájaros. No obstante, el mayordomo tuvo tiempo de poner a salvo antes a su hija, Julia. Mientras tanto, Stephanie Brown consigue lo que parece su primera gran victoria...

En Río de Janeiro, Batgirl, Capucha Roja y Batwoman obtienen pruebas de la inocencia de Jim Gordon. Bard, Killer Croc y Batman se adentran en las cloacas de Gotham para rescatar a la pequeña Jade. Y durante un motín en Blackgate, el compañero de celda de Gordon realiza una sorpredente revelación.

Un cerco mortal se estrecha en torno a Stephanie Brown por obra y gracia de su padre, el villano Cluemaster. Red Robin y Harper Row encuentran en Japón al presunto creador del nanovirus que ataca Gotham City, Sergei Alexandrov. El Pingüino y Falcone, rivales por el control del crimen, corren la misma suerte. Y mientras, en el Asilo Arkham, el Espantapájaros y el Profesor Pyg caen en las garras de las huestes del Diácono Blackfire...

Al volver de Hong Kong, Batman no solo trae respuestas sobre lo que allí hizo Falcone, sino también a una pasajera imprevista. Mientras el juicio contra Jim Gordon sigue en la ciudad, es su hija, Batgirl, la que busca en América del Sur pruebas de la inocencia del excomisario. Poco sospecha Gordon que será él mismo quien reciba la visita más inesperada de todas en la Penitenciaría de Blackgate…

Red Robin y Harper Row investigan un misterioso virus en los Narrows, Batwing y Jim Corrigan tratan de esclarecer los fenómenos extraños del Asilo Arkham y la guerra entre criminales se recrudece: Carmine Falcone destruye el Casino Iceberg y el Profesor Pyg la sede de Rhodes Motors. Sin embargo, en el Departamento de Policía parecen empeñados en arrestar a Batman... que acaba de viajar a Hong Kong para averiguar lo ocurrido allí con Falcone durante su ausencia de Gotham City.

Un futuro apocalíptico se cierne sobre Gotham. Batman y Jim Gordon se enfrentan al Profesor Pyg con resultados funestos, en forma de choque de trenes con más de 100 víctimas mortales, coincidiendo con el regreso de un viejo enemigo del Hombre Murciélago dispuesto a recuperar el control del crimen… el mafioso Carmine Falcone.

En un futuro apocalíptico, la ciudad de Batman se ha convertido en la totalitaria Nueva Gotham. Y él trabaja junto a una nueva encarnación de Nightwing: Harper Row, su joven admiradora. Ambos asaltan la guarida criminal de Selina Kyle, que ha dejado de ser Catwoman para convertirse en una implacable jefa mafiosa. Y oculta en ella a Stephanie Brown, alias Spoiler. Eso lo vimos en el núm. 28 de Batman. Sin embargo... ¿cómo podría llegar a gestarse o evitarse ese futuro? Lo veremos en Batman eterno.