Tras salvar a su amigo Seth de las garras de la Inquisición, Ellie emprende un viaje con él a través del océano, que para su sorpresa no es infinito tal como creían. Tras una larga travesía, llegan a una isla paradisíaca en la que todo parece posible. ¿Será ese el lugar en el que podrán vivir en paz?

Sin embrago, no todo es perfecto en el paraíso, y pronto descubrirán que esta isla tiene muchos secretos ocultos y grandes injusticias que resolver. Acechados por oscuros poderes que se ocultan entre las sombras, Ellie deberá enfrentarse una vez más a terribles pruebas que no solo pondrán a prueba su ingenio y valentía, sino también sus valores y su corazón.

La Ciudad: nuestro último refugio en un mundo inundado. Aquí, los señores de las ballenas nos gobiernan y la Inquisición nos controla.

El Enemigo: un oscuro poder. Siempre en busca de un cuerpo que poseer para regresar y destruirnos.

La Inventora: una joven que vive en un destartalado taller, rodeada de extraños objetos, en cuyas manos está el poder de salvarnos.

Cuando la marea trae  a un misterioso chico, todos  creen que es la reencarnación del Enemigo... Solo Ellie, la inventora, defiende la inocencia del extraño desconocido. Juntos, huirán de la Inquisición mientras intentan averiguar quién es él y lo esto puede significar para Ellie, aunque eso implique arriesgar su propia vida.